Teadlased alustavad maailma suurimat inimveres ringlevate valkude uuringut, et paremini mõista haiguste arengut ja ravi.
Täna käivitatud projekti osana jätkuvast koostööst Briti terviseuuringu UK Biobank ja enam kui tosina ravimifirma vahel, mille eesmärk on mõõta poole miljoni inimese vereproovides 5400 valgu taset. Mõnede nende inimeste puhul analüüsivad teadlased kahte eraldi proovi, mis on võetud aastatepikkuse vahega, luues "esimese omalaadse" andmebaasi selle kohta, kuidas inimese muutuv valgusisaldus mõjutab haigusi hilisemas elus, väidavad korraldajad. Projekti kümnete miljonite dollaritega toetavad ja 300 000 vereproovi esialgset analüüsi teostavad ettevõtted saavad andmetele eksklusiivse 9-kuulise juurdepääsuakna, misjärel tehakse teave laiemalt kättesaadavaks Ühendkuningriigi Biopanga poolt heaks kiidetud uurimisrühmad.
Teadlased, kes projektis ei osale, väidavad, et kogutud suur hulk andmeid võib aidata välja töötada vereanalüüse, mis tuvastavad haigused enne sümptomite ilmnemist ja tuvastavad haiguste jaoks uued ravimi sihtmärgid. "See on erakordselt võimas ressurss tervise ja haiguste mõistmiseks," ütleb Helmholtzi Müncheni translatsioonigenoomika instituudi direktor Eleftheria Zeggini.
Alates 2006. aastast on Ühendkuningriigi biopank kogunud bioloogilisi proove, meditsiinilisi pilte ja terviseandmeid enam kui 500 000 vabatahtlikult. See annab heakskiidetud teadlastele perioodiliselt välja anonüümseks muudetud terviseteabe partiid koos geneetiliste ja muude andmetega. Praegu töötab andmete kallal üle 20 000 teadlase umbes 50 riigist.
Paljud rühmad, kes otsivad haiguse biomarkereid või ravimi sihtmärke, on hinnanud verevalke erinevates patsientide populatsioonides ja tervetes inimestes, kuid mitte Ühendkuningriigi Biopanga pakutavas ulatuses. Selle valguandmete lisamine algas 2020. aastal, kui Ühendkuningriigi Biobank Pharma Proteomics Projectina töötanud 13 biofarmaatsiaettevõtet analüüsisid ligi 3000 valgu kontsentratsiooni 54 000 osaleja veres. 2023. aasta artiklis tuvastas see konsortsium rohkem kui 14 000 seost konkreetsete geneetiliste variantide ja vere valkude taseme vahel – umbes 80% neist olid varem teadmata.
Seda proteoomilist andmekogumit, mis on juba suurim omataoline, on sellest ajast alates kasutatud biomarkerite ja potentsiaalsete ravimite sihtmärkide kindlakstegemiseks selliste seisundite puhul nagu rinnavähk ja Parkinsoni tõbi. "Nende andmete üks põnevamaid rakendusi on olnud AI mudelite koolitamine haiguste ennustamiseks," lisab AstraZeneca geneetik ja konsultant Ryan Dhindsa. Tema ja teised teadlased on seda teinud masinõppe algoritmide abil, et otsida seoseid valgutasemete ja muude tegurite vahel inimese haigestumisriskiga.
Projekti järgmine etapp suurendab seda tööd 10 korda, skaneerides Ühendkuningriigi Biopanga poole miljoni osaleja esialgseid vereproove ja 100 000 osaleja järelproove, mis võeti kuni 15 aastat hiljem. See laiendatud andmekogum annab parema eraldusvõime, et uurida haigusi, mis on väiksemates uuringutes sageli "radarist alla jäänud", nagu polütsüstiliste munasarjade sündroom, motoorsete neuronite haigus ja teatud neeru- ja luuvähid, ütles Queen Mary ülikooli epidemioloog Claudia Langenberg. Londonist ja varasema andmekogumi analüüside kaastöötaja, ütles ajakirjanikele neljapäeval stardieelsel briifingul.
Esimese 300 000 proovi – 250 000 esialgse proovi ja 50 000 järelkontrolli – kallal töötamine võtab eeldatavasti aega umbes aasta ning selleks raha eraldavad 14 farmaatsiaettevõtet, sealhulgas tööstuse hiiglased nagu AstraZeneca, Pfizer ja GSK. Ühendkuningriigi biopank ei ole korraldajate sõnul ülejäänud 300 000 proovi jaoks veel rahastamist taganud.
Teadlased on huvitatud andmetest, kui need kättesaadavaks muutuvad. "Me kindlasti hüppame selle peale," ütleb Cornelia van Duijn, Oxfordi ülikooli geneetiline epidemioloog, kes teeb koostööd Ühendkuningriigi Biobanki tegevjuhi Rory Collinsi ja mõne asjassepuutuva ravimifirmaga. Ta lisab, et valgutaseme uurimine võib anda teavet inimese tervise kohta, mida tema genoom, mis on inimese elu jooksul palju rohkem fikseeritud, ei suuda. Eelkõige võib haiguse alguses tõusvate või langevate valkude tuvastamine aidata arstidel tuvastada, millal keegi hakkab haigeks jääma, ja kasu saaks varajasest ravist.
Yale'i ülikooli statistiline geneetik Hongyu Zhao hoiatab, et Ühendkuningriigi biopanga andmetel on teadaolevad piirangud, mis on tekitanud probleeme geneetilistes uuringutes ja võivad samuti raskendada teatud valkude rollide kindlaksmääramist. Peaaegu kõik osalejad on näiteks Euroopa päritolu ja kipuvad olema tervemad kui üldpopulatsioon, mis tähendab, et teadlased peaksid tulemuste tõlgendamisel olema ettevaatlikud ja proovima võimaluse korral tulemusi korrata teistes populatsioonides. Sellegipoolest on teade "suurepärane uudis", ütleb ta.
"See loob palju võimalusi. [See on] hindamatu ressurss.
